У разі подання ліцензіатом протягом тридцяти днів з дня прийняття рішення про анулювання ліцензії скарги до спеціально уповноваженого органу з питань ліцензування (Експертно-апеляційної ради при Держкомпідприємництва) дія даного рішення МОЗ України зупиняється до прийняття відповідного рішення цим органом по суті.
Рішення про анулювання ліцензії також може бути оскаржено в судовому порядку.